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Optimización de la técnica de recogida y procesamiento de muestras ambientales basadas en esponjas para la detección molecular de patógenos

Comunicación presentada en XXVII Simposio Nacional AVEDILA

14 de noviembre de 2024

Perez-Sancho M., Herranz-Benito C., Garcia-Seco T., Perello-Jiménez A., Diez-Guerrier A., Martinez-Murcia A., Dominguez M., Moreno I., Gortazar C. y Dominguez L.

En la última década, el número de estudios sobre muestreos no invasivos aplicados en sanidad animal se ha visto incrementado ya que permiten la monitorización de agentes infecciosos facilitando una cobertura espaciotemporal más amplia velando por el bienestar animal. Sin embargo, esta aproximación presenta ciertas limitaciones, ya que la cantidad y la calidad del ADN obtenido puede ser inferior a la de los muestreos tradicionales, pudiendo ser más frecuente la presencia de inhibidores de técnicas moleculares.
En el contexto de optimización de protocolos que permitan recuperar eficientemente material genético para mitigar las limitaciones asociadas a este tipo de muestras, en el presente estudio evaluamos distintos tratamientos de reconstitución de esponjas conservadas en un líquido surfactante (previamente empleadas con éxito para la detección de diversos patógenos como SARS-CoV-2 o Brucella suis) como paso previo a la extracción del material genético del líquido recogido a partir de las mismas.
Para ello se tomaron 25 esponjas (con líquido) ambientales previamente seleccionadas de puntos de muestreo de situación epidemiológica conocida y se evaluaron tres protocolos de reconstitución: (A) esponja reconstituida con 10 mL de líquido surfactante, (B) esponja no reconstituida y (C) la misma esponja de la opción B reconstituida con 10 mL de solución salina al 0,85%. Cada muestra de material genético extraído se sometió a la detección mediante PCR en tiempo real de tres dianas genéticas: IS6110 (complejo Mycobacterium tuberculosis), IS900 (M. avium subespecie paratuberculosis) e IS1111 (Coxiella burnetii).
Los resultados no mostraron diferencias estadísticamente significativas en el número de positivos entre los tres métodos para las 25 muestras seleccionadas; para IS6110: opción A 10 positivos, opción B 13 positivos, opción C 7 positivos. Para IS900: opción A 24 positivos,opción B 21 positivos y opción C 25 positivos. Para IS1111, opción A 17 positivos, opción B 19 positivos y opción C 20 positivos.
La adición de líquido surfactante para homogenizar y extraer muestras sólidas ya ha sido previamente descrita, pudiendo ser la elección del diluyente importante al afectar a la detección de microorganismos. Sin embargo, hay poca literatura comparando diferentes líquidos de reconstitución para muestras ambientales sólidas como esponjas. En nuestro estudio, la ausencia de diferencias estadísticamente significativas sugiere que, aunque la optimización de otras variables asociadas al procesamiento y extracción de ADN puedan mejorar la sensibilidad diagnóstica, algunas variables (como la elección del diluyente) asociadas con el método de manejo de muestras previo a la extracción de material genético podría tener un impacto menor, permitiendo una mayor flexibilidad en el manejo y procesamiento de este tipo de muestras. Sin embargo, la elección del diluyente para la reconstitución de muestras ambientales sólidas, como las esponjas, puede ser crítico respecto a otros aspectos como, por ejemplo, la capacidad de
inactivación de microorganismos lo que hace que sea una variable a tener en cuenta en próximas investigaciones en distintos contextos epidemiológicos





Participantes:

Universidad ComplutenseServicio de Identificación y Caracterización Microbiana (ICM). Centro de Vigilancia Sanitaria Veterinaria (VISAVET). Universidad Complutense (UCM).

Universidad ComplutenseDepartamento de Sanidad Animal. Facultad de Veterinaria. Universidad Complutense (UCM).

Gobierno de Castilla-La ManchaSanidad y Biotecnología (SaBio). Instituto de Investigación en Recursos Cinegéticos (IREC). Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC). Universidad de Castilla La Mancha (UCLM). Gobierno de Castilla-La Mancha (JCCM).

MAEVA SERVET, S.L.MAEVA SERVET, S.L..

Universidad Miguel HernándezDepartamento de Microbiología. Universidad Miguel Hernández (UMH).

Instituto de Salud Carlos IIIServicio de Inmunología. Centro Nacional de Microbiología (CNM). Instituto de Salud Carlos III (ISCIII).


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XXVII Simposio Nacional AVEDILA


XXVII Simposio Nacional  AVEDILA
13-14 noviembre de 2024
Bilbao
España

TÍTULO: Optimización de la técnica de recogida y procesamiento de muestras ambientales basadas en esponjas para la detección molecular de patógenos


TIPO: Comunicación en póster


AUTORES: Perez-Sancho M., Herranz-Benito C., Garcia-Seco T., Perello-Jiménez A., Diez-Guerrier A., Martinez-Murcia A., Dominguez M., Moreno I., Gortazar C. y Dominguez L.


First
Marta Pérez Sancho
2nd
Carmen Herranz Benito
3rd
María Teresa García-Seco Romero
5th
Alberto Antoine Díez Guerrier
7th
Mercedes Domínguez Rodríguez
8th
Inmaculada Moreno Iruela
9th
Christian Gortazar Schmidt
Last
Lucas Domínguez Rodríguez

FECHA: 14 de noviembre de 2024



CITA ESTA COMUNICACIÓN:

Perez-Sancho M., Herranz-Benito C., Garcia-Seco T., Perello-Jiménez A., Diez-Guerrier A., Martinez-Murcia A., Dominguez M., Moreno I., Gortazar C. y Dominguez L. Optimización de la técnica de recogida y procesamiento de muestras ambientales basadas en esponjas para la detección molecular de patógenos. XXVII Simposio Nacional AVEDILA, Asociación de Veterinarios Especialistas en Diagnóstico de Laboratorio, Bilbao, España, 14 de noviembre de 2024. (Comunicación en póster)


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