Metiltransferasas del ARNr 16S: un análisis genómico y epidemiológico global de un mecanismo emergente de resistencia a aminoglucósidos
Comunicación presentada en Jornadas Vigilancia Sanitaria 2023: presente y futuro para 2030
6 de julio de 2023
Serna-Bernaldo C., Delgado-Blas JF., Pulido-Vadillo M., Fernandez-Favieres FJ. y Gonzalez-Zorn B.
Las metiltransferasas del ARNr 16S (16S-RMTasas) constituyen un mecanismo emergente de resistencia a los aminoglucósidos, antibióticos ampliamente utilizados tanto en medicina humana como veterinaria para combatir infecciones causadas por bacterias gramnegativas. Desde la primera descripción de armA en 2003, se han identificado numerosas variantes (armA, rmtA-I, npmA-B) cuya prevalencia está en aumento, en gran parte debido a su exitosa asociación con elementos genéticos móviles, tales como plásmidos y transposones, que facilitan su transferencia entre diferentes especies bacterianas.
Este estudio propone un análisis genómico y epidemiológico a escala global de las 16S-RMTasas, fundamentado en datos de 4.518 aislados portadores de estas enzimas y recopilados de bases de datos públicas (GenBank y European Nucleotide Archive) con el objetivo de investigar la emergencia y diseminación de este mecanismo de resistencia.
En primer lugar, examinamos la frecuencia de aparición de las distintas variantes de 16S-RMTasas y su asociación con diversas especies bacterianas, ubicaciones geográficas y nichos ecológicos (humano, animal o ambiental). Posteriormente, analizamos el entorno genético inmediato de las variantes más frecuentes de 16S-RMTases (armA, rmtB1, rmtC y rmtF1). Este análisis tuvo como objetivo identificar elementos genéticos potencialmente responsables de la movilización de estos genes de resistencia. Mediante un enfoque basado en alineamiento y usando la herramienta BLAST v2.12.0, detectamos variaciones estructurales en las secuencias que portan estas 16S-RMTasas. Las secuencias fueron anotadas con Bakta v1.5.0 para su comparación genómica.
Observamos una predominancia de las variantes armA (n=2.480, 54,9%), rmtB1 (n=1132, 25%), rmtC (n=399, 8,8%) y rmtF1 (n=206, 4,5%) y una distribución característica de estas variantes entre diferentes especies bacterianas, por ejemplo, armA estaba estrechamente asociada con Acinetobacter baumannii o rmtB1 con Klebsiella pneumoniae. Además, identificamos variantes menos comunes como rmtI y npmA2 asociadas específicamente a patógenos grampositivos, lo que es significativo ya que estas enzimas son raramente descritas en dichas bacterias. La mayoría de los aislados positivos a 16S-RMTasas provenían de humanos (n=3.056, 67,64%), pero también identificamos variantes en muestras de origen animal, ambiental y alimentario. En el análisis de los elementos genéticos móviles asociados a las principales variantes, identificamos Tn1548, Tn2, ISEcp1 e IS91 como potenciales agentes de diseminación de estos genes.
En conclusión, este estudio proporciona una visión detallada de la frecuencia y distribución de las variantes de 16S-RMTasas, así como una perspectiva de los principales elementos genéticos móviles implicados en su propagación
Servicio de Zoonosis de Transmisión Alimentaria y Resistencia a Antimicrobianos (ZTA). Centro de Vigilancia Sanitaria Veterinaria (VISAVET). Universidad Complutense (UCM). | |
Departamento de Sanidad Animal. Facultad de Veterinaria. Universidad Complutense (UCM). | |
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