Inicio \ Divulgación \ Artículos de divulgación \


Caracterización genética mediante un chip de ADN de media densidad de poblaciones porcinas tolerantes frente a la infección con nuevas variantes del virus de la peste porcina africana

Publicado un nuevo artículo de divulgación en Actas Iberoamericanas de Conservación Animal

22 de enero de 2015

Cañon J., Gallardo C., Dunner S., Sevane N., Cortés O., Bishop R., Arias M., Sanchez-Vizcaino JM. y Carleos C.


Estudios recientes en el este de África han puesto de manifiesto una situación epidemiológica compleja en razas locales de cerdo doméstico que parecen mostrar una mayor tolerancia al virus de la peste porcina africana (VPPA), lo que favorece el carácter endémico de la enfermedad en estas regiones permitiendo su diseminación. Esta tolerancia podría tener una mayor relación con características genéticas del animal que con la propia estructura viral. En este trabajo se llevó a cabo la caracterización genética de poblaciones porcinas africanas locales, domésticas y salvajes, que pudieran estar relacionadas con tolerancia a la enfermedad de la PPA. De los animales incluidos en el análisis, 112 pertenecían a diferentes razas europeas (large white, berkshire, landrace,
middle white), 22 a híbridos de razas europeas muestreados en Kenia y Tanzania, 32 animales de poblaciones locales africanas con cierta proporción de otras razas europeas, y 22 animales de las poblaciones salvajes Phacochoerus africanus (17), y Potamochoerus larvatus (5). De ellos, 103 fueron genotipados mediante el Porcine SNP60 BeadChip v.2 (Illumina, San Diego, CA, USA) y los 85 restantes mediante el Porcine SNP60 BeadChip v.1 (Illumina, San Diego, CA, USA). Para un análisis preliminar del posicionamiento relativo de las
poblaciones incluidas en el análisis, se procedió a la elección de un conjunto de marcadores representativos y con reducido nivel de desequilibrio de ligamiento utilizando ventanas de 50 SNPs, dejando 5 SNPs entre ventanas, y se seleccionaron aquellos que tenían un valor de LD < 0,01. Este proceso de selección proporcionó 538 SNPs que se utilizaron para obtener información sobre la estructura de las poblaciones analizadas. Se comprobó la escasa utilidad del Porcine SNP60 BeadChip en las especies salvajes debido a su reducida potencia de discriminación, por lo que se procedió en una segunda etapa a genotipar 79 animales seleccionados de entre los 103 anteriores con un conjunto de 28 marcadores de tipo microsatélite, obteniéndose como resultado la imposibilidad de poder detectar hibridación entre las poblaciones domésticas locales y los suidos salvajes africanos. La identificación de tres regiones de homocigosis (ROH) consenso entre las poblaciones tolerantes.c y las de suidos salvajes, ubicadas en dos cromosomas, puede permitir la búsqueda de genes que tengan un papel relevante en la mayor tolerancia de las poblaciones de cerdo doméstico al VPPA






Ver documento en PDF
Caracterización genética mediante un chip de ADN de media densidad de poblaciones porcinas tolerantes frente a la infección con nuevas variantes del virus de la peste porcina africana

Participantes:

Universidad ComplutenseDepartamento de Producción Animal. Facultad de Veterinaria. Universidad Complutense (UCM).

Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y AlimentariaCentro de Investigación en Sanidad Animal (CISA). Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA).

Ministerio de Economía y CompetitividadMinisterio de Economía y Competitividad (MINECO).

Universidad ComplutenseDepartamento de Sanidad Animal. Facultad de Veterinaria. Universidad Complutense (UCM).

Universidad ComplutenseServicio de Inmunología Viral y Medicina Preventiva (SUAT). Centro de Vigilancia Sanitaria Veterinaria (VISAVET). Universidad Complutense (UCM).

International Livestock Research Institute (ILRI).

Universidad de OviedoUniversidad de Oviedo.








TÍTULO: Genetic characterization of porcine populations tolerant to new variants of African swine fever virus using a medium-density DNA chip


TIPO: Artículo de divulgación


AUTORES: Cañon J., Gallardo C., Dunner S., Sevane N., Cortés O., Bishop R., Arias M., Sanchez-Vizcaino JM. y Carleos C.


PARTICIPANTES VISAVET


José Manuel Sánchez-Vizcaíno Rodríguez

REVISTA: Actas Iberoamericanas de Conservación Animal


IDIOMA: Inglés y español


ISSN: 2253-9727


FECHA: 22 de enero de 2015


EDITORIAL: Red CONBIAND



CITA ESTA PUBLICACIÓN:

Cañon J., Gallardo C., Dunner S., Sevane N., Cortés O., Bishop R., Arias M., Sanchez-Vizcaino JM. y Carleos C. Genetic characterization of porcine populations tolerant to new variants of African swine fever virus using a medium-density DNA chip. Actas Iberoamericanas de Conservación Animal. Red CONBIAND. ISBN: 2253-9727. 2015. (Artículo de divulgación)


SERVICIOS: