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Caracterización genómica y resistencia a antimicrobianos de Campylobacter


6 de noviembre de 2017

Tesis Doctoral defendida por Diego Flórez Cuadrado en la Facultad de Veterinaria de la Universidad Complutense de Madrid


Las bacterias del género Campylobacter son las principales causantes de gastroenteritis de origen alimentario en todo el mundo, principalmente las especies Campylobacter jejuni y Campylobacter coli. Estos microorganismos colonizan el tracto digestivo de aves y mamíferos, siendo la principal vía de infección para las personas el consumo de carne de pollo contaminada. La infección producida por Campylobacter suele ser auto-limitante, pero ocasionalmente se producen complicaciones que requieren de tratamiento antimicrobiano, frecuentemente con eritromicina.

La resistencia a eritromicina en Campylobacter se relaciona con mutaciones en genes o proteínas ribosomales, bombas de eflujo y con la presencia del gen erm(B). Este gen había sido identificado exclusivamente en aislados de Campylobacter procedentes de China y en todos los casos estaba localizado en islas genómicas de multirresistencia. La presencia de islas genómicas que portan genes de resistencia a diferentes antimicrobianos limita las opciones terapéuticas.
En el presente trabajo de tesis doctoral se ha caracterizado una colección de aislados de C. jejuni y C. coli procedentes de animales, personas y aguas residuales. La finalidad del estudio fue la caracterización de la población por MLST y la identificación de genes de resistencia a antimicrobianos y su asociación en islas genómicas de multirresistencia. Además, se ha evaluado la presencia de perfiles de genes metabólicos en aislados pertenecientes a secuencias tipo (ST) vinculadas con campilobacteriosis en personas.

En el estudio de perfiles metabólicos se ha visto que el gen -glutamil transpeptidasa (ggt), implicado en la expresión del enzima que metaboliza la glutamina, se ha asociado significativamente con C. jejuni ST-45. Además se han identificado en aislados de C. jejuni ST-45 otros genes implicados en el metabolismo de aminoácidos tales como ansB(s), fucP y dmsA, llegándose a identificar cinco perfiles de potencial metabólico diferente. El análisis de polimorfismo genético pone de manifiesto la asociación entre determinados factores de colonización y el ST, además de evidenciar las diferentes combinaciones (en cuanto a genes metabólicos se refiere) existentes en la colección.

El estudio de los mecanismos de resistencia a macrólidos en Campylobacter dio lugar a la primera descripción en Europa del gen erm(B), asociado a una isla genómica de multirresistencia. Se ha detectado este mecanismo de resistencia en aislados de pollo y pavo, indicando el análisis genómico una destacada diversidad de estos elementos. Los resultados sugieren que la presencia del gen erm(B) en Campylobacter tiene su origen en bacterias grampositivas y los alelos identificados en este estudio han sido previamente identificados en bacterias patógenas procedentes principalmente de personas y ganado porcino de Asia y Europa. La disposición de los diferentes genes de resistencia y las secuencias detectadas apuntan a una gran movidlidad de estos elementos genéticos.

Por último, se caracterizaron por MLST, un total de 252 Campylobacter aislados de animales de abasto (portadores), personas (casos clínicos) y aguas residuales (pretratamiento), todos ellos obtenidos en España. Se identificaron otros genes de resistencia a antimicrobianos y su posible asociación con islas genómicas de multirresistencia en aislados de C. jejuni y C. coli. Se identificaron aislados multirresistentes (resistentes a tres o más clases de antimicrobianos) en muestras de animales, personas y aguas residuales. En 18 aislados de Campylobacter se identificaron diferentes islas genómicas de multirresistencia, lo que muestra una agrupación de los genes de resistencia a antimicrobianos en una misma secuencia de ADN. Las islas genómicas de multirresistencia se han identificado en aislados procedentes de animales, personas y aguas residuales, sugiriéndose que estas secuencias genéticas son potenciales vehículos de dispersión de genes de resistencia a antimicrobianos.








Tesis doctoral de Diego Flórez Cuadrado: Caracterización genómica y resistencia a antimicrobianos de Campylobacter Diego Flórez Cuadrado

TÍTULO: Genomic characterization and antimicrobial resistance of Campylobacter


TIPO: Tesis doctoral


AUTOR: Diego Flórez Cuadrado


DIRECTORES: Dominguez L., Porrero MC. y Quesada A.


FECHA: 6 de noviembre de 2017


IDIOMA: English-spanish



CITA ESTA PUBLICACIÓN:

Diego Flórez Cuadrado. Genomic characterization and antimicrobial resistance of Campylobacter. Universidad Complutense de Madrid. 6 de noviembre de 2017.


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