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Información
BD Nacional de Micobacteriosis Animal
Versión 2.5
Datos actualizados a 3 de agosto 2017
Copyright © 2017 VISAVET
40727
aislamientos
540
espoligotipos
179
MIRU-VNTRtipos
Base de Datos Nacional de Micobacteriosis Animal mycoDB: Convenio de Colaboración MARM-UCM

Ministerio de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino - Universidad Complutense de Madrid

      El Centro de Vigilancia Sanitaria Veterinaria es responsable de la base de datos que recoge los registros nacionales de micobacteriosis animal desde 1996 hasta la actualidad.


La base de datos se complementa con un visor que muestra la distribución geográfica de los aislamientos de Micobacterias según criterios de consulta como el año, especie animal o espoligotipo implicado.

El acceso a esta base de datos está disponible a través de la página web de la Red de Alerta Sanitaria (RASVE) del Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente, para los Servicios Veterinarios y Laboratorios que participan en el Programa Nacional de Erradicación de la Tuberculosis Bovina.

DVR - spoligotyping

DVR spoligotyping

      La técnica "Direct Variable Repeat Spacer Oligonucleotide Typing" se basa en la amplificación de una región del genoma denominada locus DR (direct repeat). Esta región está compuesta por secuencias repetidas (DR) separadas por secuencias denominadas espaciadores a los que va dirigida la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y que son detectados mediante hibridación de los productos generados a una membrana con oligonucleótidos unidos covalentemente. Al final del protocolo se obtiene un patrón (perfil de espoligotipo), caracterizado por la presencia o ausencia de espaciadores. Esta técnica es específica para especies bacterianas del complejo M.tuberculosis (M.tuberculosis, M.bovis, M.caprae, M.africanum, M.pinnipedii y M.microti). Actualmente, el DVR-spoligotyping es la técnica de elección para la realización de estudios de epidemiología molecular (transmisión animales salvajes y domésticos, movimiento de animales, aislados específicos de una región geográfica, estudio de brotes, etc.)



Referencias:

Aranaz A, Liébana E, Mateos A, Dominguez L, Vidal D, Domingo M, Gonzolez O, Rodriguez-Ferri EF, Bunschoten AE, Van Embden JD, Cousins D. Spacer oligonucleotide typing of Mycobacterium bovis strains from cattle and other animals: a tool for studying epidemiology of tuberculosis. J Clin. Microbiol. 34(11):2734-40. 1996.

Kamerbeek J., Schouls L, Kolk A, van Agterveld M, van Soolingen D, Kuijper S, Bunschoten A, Molhuizen H, Shaw R, Goyal M, van Embden J. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J Clin. Microbiol. 35(4):907-14. 1997.



MIRU-VNTR

      La técnica de Mycobacterial Interspersed Repetitive Units -Variable Number Tandem Repeats (MIRU-VNTR) está basada en una PCR que amplifica una selección de MIRU-VNTR loci.

Estos loci son elementos que se repiten en tándem (de 40 a 120 pares de bases) y localizados principalmente en regiones intergénicas del genoma de los miembros del complejo Mycobacterium tuberculosis.

El número de repeticiones de cada secuencia del locus se estima analizando el tamaño del producto de PCR después de la migración electroforética. Los loci que se han descrito como más discriminatorios para los aislados de M. bovis son, entre otros, el VNTR 3232, QUB 11a, QUB 11b, ETR-A, ETR-B y MIRU 26 loci. Sin embargo, el análisis MIRU-VNTR todavía no está estandarizado para M. bovis  y la diversidad alélica puede variar entre los países.

Este protocolo está siendo una técnica importante de caracterización molecular ya que permite un análisis reproducible y discriminatorio de las cepas del complejo de Mycobacterium tuberculosis. Esta técnica se ha propuesto como técnica para la caracterización de cepas del complejo M. tuberculosis en combinación con el DVR-spoligotyping.

En la actualidad el Centro de Vigilancia Sanitaria Veterinaria emplea esta técnica en el estudio de brotes epidemiológicos específicos.



Referencias:

Frothingham R, Meeker-O'Connell WA. Genetic diversity in the Mycobacterium tuberculosis complex based on variable numbers of tandem DNA repeats. Microbiology. 1998 May;144 (5):1189-96.

Aranaz A, Romero B, Montero N, Alvarez J, Bezos J, de Juan L, Mateos A, Dominguez L. Spoligotyping profile change caused by deletion of a direct variable repeat in a Mycobacterium tuberculosis isogenic laboratory strain. J Clin Microbiol. 2004 Nov;42(11):5388-91.

Prodinger WM, Brandstätter A, Naumann L, Pacciarini M, Kubica T, Boschiroli ML, Aranaz A, Nagy G, Cvetnic Z, Ocepek M, Skrypnyk A, Erler W, Niemann S, Pavlik I, Moser I. Characterization of Mycobacterium caprae isolates from Europe by mycobacterial interspersed repetitive unit genotyping. J Clin Microbiol. 2005 Oct;43(10):4984-92.

Romero B, Aranaz A, de Juan L, Alvarez J, Bezos J, Mateos A, Gomez-Mampaso E, Dominguez L. Molecular epidemiology of multidrug-resistant Mycobacterium bovis isolates with the same spoligotyping profile as isolates from animals. J Clin Microbiol. 2006 Sep;44(9):3405 -8.

Romero B, Aranaz A, Sandoval A, Alvarez J, de Juan L, Bezos J, Sanchez C, Galka M, Fernandez P, Mateos A, Dominguez L. Persistence and molecular evolution of Mycobacterium bovis population from cattle and wildlife in Doñana National Park revealed by genotype variation. Vet Microbiol. 2008 Nov 25;132(1-2):87-95






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