Trabajo Fin de Grado defendido por Irene del Corral Medina

20 de julio de 2023

Escherichia coli es un microorganismo que forma parte de la microbiota intestinal comensal de mamíferos, pero que también puede causar infecciones con consecuencias clínicas. Esta bacteria puede presentar una gran diversidad de mecanismos de resistencia antimicrobiana, siendo la producción de betalactamasas de espectro extendido (BLEEs), betalactamasas tipo AmpC y carbapenemasas, de los más preocupantes. Dichas enzimas confieren resistencia a los betalactámicos, una de las familias de antimicrobianos más utilizada en medicina humana y veterinaria. La creciente presencia de E. coli productor de BLEEs/AmpC en humanos y animales ha generado la necesidad de vigilar y monitorizar su distribución en los distintos compartimentos (animales, humanos y medioambiente). Este estudio tiene como objetivo principal la caracterización de una selección de cepas de E. coli productoras de BLEEs/AmpC procedentes de muestras de animales de producción, con el fin de determinar la diversidad y evolución de los fenotipos de resistencia presentes y los mecanismos de resistencia asociados. Para ello, se ha utilizado la base de datos “ESBL-EC” del Centro VISAVET-UCM, que recopila información de 2.226 cepas de E. coli identificadas como potencialmente productoras de BLEEs/AmpC y/o carbapenemasas. Estas cepas se aislaron de muestras de contenido cecal de pavo, pollo broiler, porcino y bovino entre los años 2014 y 2018. A partir de estos datos, se clasificaron los aislados según sus fenotipos de resistencia, se secuenció el genoma completo de una selección de aislados y se realizó un análisis estadístico de los datos obtenidos. Los resultados revelan que una elevada proporción de aislados (77,7%) presentó multirresistencia. Además, se determinó que la probabilidad de resistencia de una cepa a un determinado antibiótico depende de la especie hospedadora (p<0,001), aunque se observó una similitud en las tendencias de ciertos antibióticos entre los datos de bovino-porcino y broiler-pavo. La familia de genes BLEEs CTX-M fue la más abundante en el cepario, aunque, específicamente, el gen blaSHV-12 se detectó en un mayor número de aislados. En conclusión, este estudio muestra que las características fenotípicas y genotípicas de cada especie son únicas, pero también revela similitudes que podrían indicar la existencia de fenómenos similares de selección, la exposición a fuentes comunes de cepas resistentes y/o el intercambio de aislados entre las especies hospedadoras