Poster presentado en Jornadas Vigilancia Sanitaria 2023: presente y futuro para 2030

6 de julio de 2023

Lorente-Leal V., Pozo P., Gutierrez A., Lozano F., Saez JL., Bezos J., de Juan L., Alvarez J. y Romero B.

La tuberculosis (TB) animal es una enfermedad infectocontagiosa producida por micobacterias pertenecientes al complejo Mycobacterium tuberculosis (CMTB) que afecta principalmente a los mamíferos. Esta enfermedad tiene una gran relevancia para la salud pública y animal, debido a su carácter zoonósico y su efecto negativo en la ecología, el bienestar y la producción animal, especialmente en el ganado bovino. En la última década (2010-2021), la prevalencia de rebaño de la TB en ganado bovino de la Comunidad de Madrid (CM) ha disminuido desde el 5,45% hasta el 2,76%, aún por encima de la prevalencia de rebaño nacional (1,48%). Determinar el parentesco entre los aislados del CMTB es fundamental para identificar las posibles causas de los brotes de TB y establecer medidas con las que alcanzar la erradicación de la enfermedad.
Debido a la naturaleza clonal de los miembros del CMTB, la secuenciación masiva de genomas (WGS, por sus siglas en inglés) representa una herramienta de gran interés dada su elevada resolución y rendimiento.
El objetivo de este estudio fue evaluar el uso de la WGS para determinar la diversidad genética de M. bovis, el agente etiológico principal de la TB animal en nuestro país, en la CM, con el fin de generar mapas genéticos que puedan ser de utilidad en el estudio de brotes de TB animal. Se seleccionaron 200 aislados de M. bovis, procedentes en su mayoría de ganado bovino (n = 178), obtenidos entre los años 2015 y 2022. Los aislados procedíeron de 106 unidades epidemiológicas (mediana: 1 aislado por localización [rango intercuartílico: 1-2]), incluyendo 95 explotaciones ganaderas, en 43 municipios de la CM. Los aislados fueron secuenciados mediante tecnología Illumina y se identificaron los polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs, por sus siglas en inglés) presentes en las secuencias obtenidas frente a un genoma de referencia empleando la herramienta bioinformática vSNP 2.0. Se realizó un análisis de conglomerados mediante BAPS para identificar y definir posibles clados y subclados genéticos.
Se identificaron siete clados genéticos (1, 2, 3, 4, 5, 6 y X) con una gran diversidad, con distancias intra-clado de entre 28 (clado 5) y 250 (clado 3) SNPs de mediana. Algunos clados se agruparon espacialmente; el clado 2 se localizó en la Sierra Norte y el Corredor del Henares y el clado 4 lo hizo a lo largo de toda la Sierra de Madrid. Se detectó solapamiento geográfico entre los clados 1, 2 y 4, lo cual indica la circulación simultanea de distintos linajes genéticos en algunas zonas. Se identificaron 62 unidades epidemiológicas con aislados muy similares a otros obtenidos en otra localización de la CM, lo cual sugiere la presencia de posibles vínculos epidemiológicos entre éstas. Finalmente, se identificaron 28 unidades con una diversidad intrarebaño más elevada (≥ 6 SNPs), lo cual podría reflejar múltiples introducciones en el pasado o la presencia de una elevada diversidad genética en el entorno.
Los resultados de este estudio demuestran la gran utilidad de la WGS para el estudio de
M. bovis en la CM y reflejan la existencia de una gran diversidad genética, lo cual podría
reflejar la circulación histórica de este patógeno en esta Comunidad Autónoma y en el resto de España

	Servicio de Micobacterias (MYC). Centro de Vigilancia Sanitaria Veterinaria (VISAVET). Universidad Complutense (UCM).
	Sanidad y Biotecnología (SaBio). Instituto de Investigación en Recursos Cinegéticos (IREC). Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC). Universidad de Castilla La Mancha (UCLM). Gobierno de Castilla-La Mancha (JCCM).
	Subdirección General de Sanidad e Higiene Animal y Trazabilidad. Dirección General de la Producción Agraria. Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación (MAPA).
	Departamento de Sanidad Animal. Facultad de Veterinaria. Universidad Complutense (UCM).

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