Comunicación oral en XXVI Edición del Simposio Nacional AVEDILA

20 de noviembre de 2023

Lorente-Leal V., Pozo P., Gutierrez A., Vinolo C., Saez-LLorente JL., Bezos J., de Juan L., Alvarez J. y Romero B.

La tuberculosis (TB) animal es una enfermedad infectocontagiosa producida por micobacterias pertenecientes al complejo Mycobacterium tuberculosis (CMTB) que afecta principalmente a los mamíferos. Además de su relevancia en sanidad pública debido a su carácter zoonósico, esta enfermedad tiene un gran impacto en la ecología, el bienestar y la producción animal. Por ello, su control y erradicación en el ganado bovino, la especie doméstica más afectada, han sido objetivos importantes en la Unión Europea y España en las últimas décadas. Una piedra angular de la erradicación consiste en identificar y diferenciar los brotes de TB, lo cual se fundamenta en
el uso de técnicas genéticas y estudios de epidemiología molecular. Tradicionalmente, las técnicas empleadas para tal cometido, el espoligotipado y los MIRU-VNTR, se basan en una pequeña porción del genoma micobacteriano. A pesar de su uso extendido y gran utilidad, estas técnicas presentan una baja resolución debido a la naturaleza clonal de los miembros del CMTB, por lo que su aplicación en estudios de brotes se ve limitada en determinados contextos epidemiológicos. En los últimos años ha aumentado el interés por el uso de la secuenciación masiva de genomas (WGS por sus siglas en inglés), debido a su gran capacidad de análisis y resolución al nivel de nucleótido.
El objetivo de este estudio fue evaluar el uso de la WGS para determinar la diversidad genética de M. bovis, el agente etiológico principal de la TB animal en nuestro país, en la Comunidad de Madrid (CM), con el fin de generar mapas genéticos que puedan ser de utilidad en el estudio de brotes de TB animal en el futuro. Se seleccionaron 248 aislados de M. bovis, procedentes en su mayoría de ganado bovino (86,69%; n = 215), obtenidos entre los años 2015 y 2022. Los aislados procedieron de 135 unidades epidemiológicas (U.E.) (mediana: 1 aislado por localización [rango intercuartílico: 1-2]), incluyendo 118 explotaciones ganaderas, en 43 municipios de la CM. Los aislados fueron secuenciados mediante tecnología Illumina y se identificaron los polimorfismos
de un solo nucleótido (SNPs, por sus siglas en inglés) presentes en las secuencias obtenidas frente a un genoma de referencia empleando la herramienta bioinformática vSNP 2.0. Se realizó un análisis de conglomerados mediante BAPS para identificar y definir posibles clados y subclados genéticos.
Se identificaron cuatro clados genéticos con una elevada diversidad intra-clado distancia mediana: 51-563 SNPs) que corresponde con la gran diversidad de espoligotipos muestreados y podría reflejar el largo historial de endemicidad de la TB animal en la CM y el resto de España.
Se detectó una elevada diversidad intra-rebaño, donde el 76,5% de las U.E. presentó una distancia genética máxima > 5 SNPs, lo cual sugiere múltiples introducciones de la infección y/o una fuente de infección con una elevada diversidad. Por otro lado, la similitud genética aumentó entre pares de aislados procedentes de U.E. distintas a medida que la distancia geográfica disminuyó, lo cual podría sugerir que las U.E. con aislados muy similares podrían estar relacionadas por cercanía y/o compartir factores de riesgo tales como pastos comunales, movimientos de animales infectados no detectados mediante las técnicas diagnósticas ante mortem o la presencia de fauna salvaje infectada.
Este estudio refleja el gran valor añadido que ofrece la WGS para el estudio epidemiológico de la TB animal en la CM, y por extensión, al resto de España. La detección de posibles agrupaciones geográficas en determinados aislados de M. bovis sugiere la presencia de vínculos entre U.E., lo cual podría ser de ayuda para identificar factores de riesgo e implementar medidas de contingencia con las que limitar la extensión de la enfermedad

	Servicio de Micobacterias (MYC). Centro de Vigilancia Sanitaria Veterinaria (VISAVET). Universidad Complutense (UCM).
	Sanidad y Biotecnología (SaBio). Instituto de Investigación en Recursos Cinegéticos (IREC). Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC). Universidad de Castilla La Mancha (UCLM). Gobierno de Castilla-La Mancha (JCCM).
	Subdirección General de Sanidad e Higiene Animal y Trazabilidad. Dirección General de la Producción Agraria. Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación (MAPA).
	Departamento de Sanidad Animal. Facultad de Veterinaria. Universidad Complutense (UCM).

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